Al fine di ottenere una migliore efficacia di intervento, l'AIS Seguimi crede fermamente nella collaborazione e nel lavoro di rete. Si coordina con enti e associazioni, istituzioni pubbliche e private, organismi internazionali, scuole e gruppi di base.

A livello federativo l'AIS è affiliato alle seguenti organizzazioni:

C.I.S.M.A.I. (Coordinamento Italiano dei Servizi contro il Maltrattamento e Abuso all'Infanzia).

C.I.P.S.I. (Coordinamento di Iniziative Popolari di Solidarietà Internazionale) una federazione nazionale di oltre 50 organizzazioni di cooperazione internazionale.

E' iscritta all'albo degli Enti di Servizio Civile e quindi opera anche attraverso progetti di servizio civile volontario.